Ketika seorang siswa memasuki perguruan tinggi, tentua ia akan menemui banyak perbedaan dengan kehidupan masa SMA-nya. Ia perlu mengenal dan beradaptasi dengan perubahan-perubahan yang ada tersebut. Oleh karena itu, IAIN Pekalongan menggelar acara orientasi mahasiswa baru yang berada di bawah rangkaian  PBAK (Pengenalan Budaya Akademik dan Kemahasiswaan). Tujuan diadakannya PBAK ini antara lain a. Mengembangkan pemahaman dan penghayatan peserta terhadap sistem pendidikan di perguruan tinggi; b. Mengembangkan kecerdasan spiritual, emosional, intelektual, dan sosial. c. Memupuk semangat solidaritas dan toleransi di antara civitas akademika; d. Mengembangkan rasa memiliki dan tanggung jawab akademik sosial terhadap pilihan disiplin ilmu; e. Mengembangkan sikap kritis dan kreatif mahasiswa. 

PBAK di lingkungan perguruan tinggi merupakan langkah awal bagi mahasiswa baru untuk mengenal sejarah kampus, lembaga-lembaga kampus, jenis-jenis kegiatan akademik, sistem kurikulum, model pembelajaran, pimpinan perguruan tinggi dan lain-lainnya. Selain itu, diharapkan PBAK bisa menjadi wahana awal antar sesama mahasiswa baru untuk saling mengenal, menjalin komunikasi dan mempererat silaturahmi, di samping fungsi utamanya sebagai orientasi penyadaran mahasiswa sebagai insan akademik yang memiliki tanggungjawab sosial dan akademik sebagaimana tertuang dalam Tri Dharma Perguruan Tinggi.

Adapun rangkaian kegiatan PBAK ini antara lain:

1. Pengenalan kampus (profil IAIN Pekalongan)

2. Pengenalan Sistem Akademik Institut

3. Pengenalan Organisasi Kemahasiswaan (SEMA, DEMA, UKM, dan UKK)

4. Upacara Peringatan Hari Kemerdekaan RI